A GacS deficiency does not affect<i>Pseudomonas chlororaphis</i>PA23 fitness when growing on canola, in aged batch culture or as a biofilm
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas chlororaphis PA23 is a biocontrol agent that protects against the fungal pathogen Sclerotinia sclerotiorum. Employing transposon mutagenesis, we isolated a gacS mutant that no longer exhibited antifungal activity. Pseudomonas chlororaphis PA23 was previously reported to produce the nonvolatile antibiotics phenazine 1-carboxylic acid and 2-hydroxyphenazine. We report here that PA23 produces additional compounds, including protease, lipase, hydrogen cyanide, and siderophores, that may contribute to its biocontrol ability. In the gacS mutant background, generation of these products was markedly reduced or delayed with the exception of siderophores, which were elevated. Not surprisingly, this mutant was unable to protect canola from disease incited by S. sclerotiorum. The gacS mutant was able to sustain itself in the canola phyllosphere, therefore, the loss of biocontrol activity can be attributed to a reduced production of antifungal compounds and not a declining population size. Competition assays between the mutant and wild type revealed equivalent fitness in aged batch culture; consequently, the gacS mutation did not impart a growth advantage in the stationary phase phenotype. Under minimal nutrient conditions, the gacS-deficient strain produced a tenfold less biofilm than the wild type. However, no difference was observed in the ability of the mutant biofilm to protect cells from lethal antibiotic challenge.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».