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Enregistrement W1993435848 · doi:10.1111/irv.12099

Detection of influenza <scp>C</scp> virus by a real‐time <scp>RT</scp>‐<scp>PCR</scp> assay

2013· article· en· W1993435848 sur OpenAlexaffabout
Kanti Pabbaraju, Sallene Wong, Anita Wong, Jennifer May‐Hadford, Raymond Tellier, Kevin Fonseca

Notice bibliographique

RevueInfluenza and Other Respiratory Viruses · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of CalgaryPublic Health Agency of CanadaProvincial Laboratory of Public HealthHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyVirusHemagglutinin (influenza)Respiratory tract infectionsOutbreakEpidemiologyInfluenza A virusReal-time polymerase chain reactionMedicineOrthomyxoviridaeRespiratory systemMicrobiologyBiologyImmunologyGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Influenza C virus can cause both upper and lower respiratory tract infections and has been reported to be prevalent in children. However, these infections have been under-diagnosed, and epidemiological data available are limited due to the lack of convenient detection assays. OBJECTIVE: Design and validate a real-time reverse-transcriptase PCR (rt RT-PCR) assay for the detection of influenza C. STUDY DESIGN: Respiratory samples from two primary settings, namely, children who were hospitalized or seen in the emergency department, and respiratory outbreaks for which no other viral etiology was found were used for the detection of influenza C. RESULTS AND CONCLUSIONS: The assay was sensitive and specific for the detection of influenza C. Eleven of 474 (2·32%) patients, all less than 10 years of age, were positive for influenza C. The strains clustered into two lineages, namely C/Kanagawa and C/Sao Paulo, based upon sequencing of the hemagglutinin-esterase gene. Epidemiological data showed that a higher proportion of influenza C infections occur in younger children and during the winter months. This is the first report of the detection of influenza C in Alberta, Canada, and suggests that the detection of this virus should be included in respiratory virus testing panels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,689
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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