MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1993449328 · doi:10.1074/jbc.m114.575878

TIF1γ Protein Regulates Epithelial-Mesenchymal Transition by Operating as a Small Ubiquitin-like Modifier (SUMO) E3 Ligase for the Transcriptional Regulator SnoN1

2014· article· en· W1993449328 sur OpenAlexafffund
Yoshiho Ikeuchi, Shorafidinkhuja Dadakhujaev, Amrita Singh Chandhoke, Mai Anh Huynh, Anna Oldenborg, Mikako Ikeuchi, Lili Deng, Eric J. Bennett, J. Wade Harper, Azad Bonni, Shirin Bonni

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésSUMO proteinUbiquitin ligaseEpithelial–mesenchymal transitionBiologyCell biologyUbiquitinRegulatorNEDD4Gene isoformTranscriptional regulationUbiquitin-Protein LigasesTransition (genetics)BiochemistryTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epithelial-mesenchymal transition (EMT) is a fundamental cellular process that contributes to epithelial tissue morphogenesis during normal development and in tumor invasiveness and metastasis. The transcriptional regulator SnoN robustly influences EMT in response to the cytokine TGFβ, but the mechanisms that regulate the fundamental role of SnoN in TGFβ-induced EMT are not completely understood. Here we employ interaction proteomics to uncover the signaling protein TIF1γ as a specific interactor of SnoN1 but not the closely related isoform SnoN2. A 16-amino acid peptide within a unique region of SnoN1 mediates the interaction of SnoN1 with TIF1γ. Strikingly, although TIF1γ is thought to act as a ubiquitin E3 ligase, we find that TIF1γ operates as a small ubiquitin-like modifier (SUMO) E3 ligase that promotes the sumoylation of SnoN1 at distinct lysine residues. Importantly, TIF1γ-induced sumoylation is required for the ability of SnoN1 to suppress TGFβ-induced EMT, as assayed by the disruption of the morphogenesis of acini in a physiologically relevant three-dimensional model of normal murine mammary gland (NMuMG) epithelial cells. Collectively, our findings define a novel TIF1γ-SnoN1 sumoylation pathway that plays a critical role in EMT and has important implications for our understanding of TGFβ signaling and diverse biological processes in normal development and cancer biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207