<i>Phormidium Retzii</i> (Oscillatoriales): Genotypic Variation and Phenotypic Plasticity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Phormidium retzii is one of the most commonly encountered lotic taxa in North America and has been recorded from a wide range of habitats worldwide. The genetic variability of this cosmopolitan, freshwater cyanobacterium was assessed using gene sequences and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. Strains consistent with the morphological species circumscription were utilized from British Columbia, Canada to Rio Claro, Costa Rica, and from Rhode Island to Washington State, USA. In addition, some strains were from geographically close (<25 miles apart) sites. The 16S rRNA gene was sequenced for eight of the 12 strains. Sequence homology ranged from 90.95 to 98.71. The nine RAPD primers utilized yielded a total of 133 distinct bands from the 12 strains. The strains were variously related and showed great variation in pairwise genetic distances (0.23–0.83). Given the lack of sequence similarity, P. retzii as presently circumscribed most likely represents several cryptic species not clearly distinguishable with light microscopy of morphological characters. This conclusion may explain the lack of correlation between geographic proximity and genetic similarity. To assess the level of environmentally induced phenotypic plasticity of this taxon, one strain was subjected to three different current velocity and nutrient regimes (low, medium, and high) employing six stream mesocosms. ANOVAs and Bonferroni multiple comparison tests were performed with cell volumes, ratios of cell length : width and percent cover data. Low nutrient treatments elicited significantly (P < 0.05) greater cell volumes and percent cover than did high treatments. Furthermore, current velocity did not show any significant effect on cell morphology. As such, it appears that a single strain is capable of wide morphological variability in response to some environmental conditions. The results of these two studies have great implications in the utilization of cyanobacterial morphospecies concepts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».