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Enregistrement W1993541158 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-3410

Abstract 3410: A novel regulatory region of the MYC oncogene decreases Myc transcriptional activity

2014· article· en· W1993541158 sur OpenAlexaff
Manpreet Kalkat, Amanda R. Wasylishen, Pak-Kei Chan, Aleksandra A. Pandyra, Sam Sulgi Kim, Christina Bros, Brian Raught, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factorCarcinogenesisOncogeneMutantBiologyCancer researchProto-Oncogene Proteins c-mycLysineGeneCell biologyGeneticsCell cycleAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract MYC is a transcription factor that contributes to over 50% of cancers. While deregulated protein expression of MYC is an important factor driving tumorigenesis, remarkably little is known about the post-translational modifications (PTMs) that are necessary for MYC to function as an active oncogene. Given the important role of PTMs in the regulation of protein activity and stability, our overall objective is to further characterize novel PTMs of MYC, and the functional contribution of these modifications to the ability of the MYC to transform cells. Using a structure-function approach, we have identified six C-terminal lysines that can modulate the ability of MYC to transform cells. By utilizing lysine to arginine mutations (6KR) to abrogate signaling through these residues, we show that MYC 6KR increases anchorage-independent colony growth compared with MYC-WT. Moreover, this mutant was also more potent than WT in promoting xenograft tumour growth. Through target gene expression analysis and luciferase reporter assays, we show that 6KR has enhanced transcriptional activity compared with MYC-WT. To characterize the modifications that can occur at these lysine residues, we have performed mass spectrometry analysis and have identified a number of PTMs that can occur in this region. Furthermore, we have conducted BioID to identify MYC interactors that change in association with 6KR MYC compared to MYC-WT. We theorize that identifying the signaling pathways leading to post-translational modification of this region will be an important first step in the development of inhibitors targeting MYC induced transformation. Citation Format: Manpreet Kalkat, Amanda Wasylishen, Pak-Kei Michael Chan, Aleksandra Pandyra, Sam Sulgi Kim, Christina Bros, Brian Raught, Linda Z. Penn. A novel regulatory region of the MYC oncogene decreases Myc transcriptional activity. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 3410. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-3410

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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