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Enregistrement W1993573575 · doi:10.1172/jci8592

High-level expression of Egr-1 and Egr-1–inducible genes in mouse and human atherosclerosis

2000· article· en· W1993573575 sur OpenAlexaff
Timothy A. McCaffrey, Chenzhong Fu, Baoheng Du, Sukru Eksinar, K. Craig Kent, Harry L. Bush, Karl H. Kreiger, Todd K. Rosengart, Myron I. Cybulsky, Eric S. Silverman, Tucker Collins

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyGene expressionLesionInflammationFibrous capCell biologyGeneVascular smooth muscleMolecular biologyPathologyEndocrinologyImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To understand the mRNA transcript profile in the human atherosclerotic lesion, RNA was prepared from the fibrous cap versus adjacent media of 13 patients undergoing carotid endarterectomy. cDNA expression arrays bearing 588 known genes indicated that lesions express unexpectedly high levels of the early growth response gene, Egr-1 (NGFI-A), a zinc-finger transcription factor that modulates a cluster of stress-responsive genes including PDGF and TGF-beta. Expression of Egr-1 was an average of 5-fold higher in the lesion than in the adjacent media, a result confirmed by RT-PCR, and many Egr-1-inducible genes were also strongly elevated in the lesion. Time-course analyses revealed that Egr-1 was not induced ex vivo. Immunocytochemistry indicated that Egr-1 was expressed prominently in the smooth muscle-actin positive cells, particularly in areas of macrophage infiltration, and in other cell types, including endothelial cells. Induction of atherosclerosis in LDL receptor-null mice by feeding them a high-fat diet resulted in a progressive increase in Egr-1 expression in the aorta. Thus, induction of Egr-1 by atherogenic factors may be a key step in coordinating the cellular events that result in vascular lesions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,205
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations298
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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