Cloning and expression of a 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase gene from<i>Halomonas variabilis</i>
Notice bibliographique
Résumé
A novel 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS) gene of 1.35 kb was cloned from a cosmid library of Halomonas variabilis HTG7, inserted into vector pET-28a (+) and transformed in Escherichia coli BL21 (DE3). EPSPS was over-expressed in soluble form after induction with IPTG at 30 degrees C and it showed a single band in SDS-PAGE, which corresponds to a molecular weight of 51 kD. Deduced amino acid sequence analysis showed that there is little homology with the aroA genes which encode glyphosate-tolerant EPSPS in known sources, such as E. coli K12 and Agrobacterium sp. CP4. The over-expressed EPSPS was purified on nickel-nitrilotriacetic acid resin and detected by Western blotting analysis. Enzyme activity measurements demonstrated that there were 4.27 units/mg in cell extract, compared with 0.049 units/mg of the control. There is an 87-fold increase in specific activity for EPSPS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».