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Enregistrement W1993628564 · doi:10.1074/jbc.m508356200

Features of the Catalytic Domains and C Termini of the MAPK Signal-integrating Kinases Mnk1 and Mnk2 Determine Their Differing Activities and Regulatory Properties

2005· article· en· W1993628564 sur OpenAlexaff
Josep Lluís Parra, Maria Buxadé, Christopher G. Proud

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKinaseMAPK/ERK pathwayComputational biologyCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The MAPK signal-integrating kinases Mnk1 and Mnk2 are closely related but show marked differences in their basal activities and regulation. Both possess, within their C termini, motifs for binding to MAPKs, although these differ between Mnk1 and Mnk2. Mnk2 shows much higher activity in unstimulated cells than Mnk1, whose activity is greatly increased, e.g. by stimulation of the MEK/ERK pathway. Such increases are sensitive to blockade of that pathway, whereas the activation state of Mnk2 is relatively insensitive to inhibition of upstream signaling. Here we have studied the roles of features in their catalytic domains and C termini in determining their regulatory properties and basal activities. Mnk2 can bind to phosphorylated, active ERK, whereas Mnk1 cannot. Such binding apparently protects ERK against dephosphorylation and inactivation. The high basal activity of Mnk2 and its binding to (phospho)ERK requires features both of the catalytic domain and of the C terminus. For example, within the catalytic region an aspartate in Mnk2 plays a key role. Mutation to alanine inactivates Mnk2. In the C terminus, features within the MAPK-binding motif and to either side of it, including potential phosphorylation sites, affect MAPK binding and activity. The association of Mnks with the scaffold protein eukaryotic initiation factor 4G is negatively modulated by Mnk activity. These data indicate that multiple features determine the activities of the Mnks and thus impact on their ability to phosphorylate physiological substrates such as eukaryotic initiation factor 4E.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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