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Enregistrement W1993653808 · doi:10.1093/molbev/msg053

Rapid Evolution of the Sex-Determining Gene, transformer: Structural Diversity and Rate Heterogeneity Among Sibling Species of Drosophila

2003· article· en· W1993653808 sur OpenAlex
Rob J. Kulathinal

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology and Evolution · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMelanogasterDrosophila melanogasterMauritianaGene duplicationGeneticsEvolutionary biologyGeneTandem exon duplicationConcerted evolutionLocus (genetics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While developmentally regulated genes are generally conserved, transformer (tra), a key locus involved in the regulation of sexual differentiation, is highly diverged between species of Drosophila. With an aim to understand its divergence between sibling species, we investigated tra sequence variation among members of the Drosophila melanogaster species complex, D. melanogaster, D. simulans, D. mauritiana, and D. sechellia. In this species group, tra divergence is rapid yet clocklike and exhibits large differences in protein size. D. melanogaster contains a 13-amino acid tandem duplication, whereas D. sechellia possesses a 72-amino acid tandem duplication representing a 30% increase in total amino acid residues. We also found evidence of a nonrandom distribution of replacement substitutions and heterogeneity in substitution rates using clustering statistics and a codon substitution model. We show that tra's rapid divergence in this species complex is the result of generally lower selective constraints around regions that encode arginine-serine (RS) domains and a significantly higher rate of substitutions around the insertion site of D. sechellia's large duplication. The proximity of rapidly diverged regions to sites of nucleotide insertion suggests that higher local rates of mutation may provide a causal mechanism for TRA's rapid divergence in this subgroup. A comparison of tra orthologs across the genus Drosophila suggest that TRA maintains an assortment of RS domains for proper sex determining function while much of the protein evolves relatively unconstrained.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,479

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle