Characterization of a <i>waaF</i> mutant of <i>Helicobacter pylori</i> strain 26695 provides evidence that an extended lipopolysaccharide structure has a limited role in the invasion of gastric cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
An LD-heptosyltransferase gene, HP1191 (waaF), involved in biosynthesis of the inner-core region of Helicobacter pylori strain 26695 lipopolysaccharide (LPS), has been cloned and its function established by complementation of Salmonella enterica serovar Typhimurium waaF mutant strain, strain 3789. Insertional inactivation of the HP1191 open reading frame in strain 26695 resulted in the formation of a deeply truncated LPS molecule, as observed using SDS-PAGE. Subsequent compositional and fatty acid analyses, followed by capillary electrophoresis - mass spectrometry and nuclear magnetic resonance studies established its structure as the following: PE-->7)-L-alpha-D-Hepp-(1-->5)-alpha-Kdop-(2-->6)-Lipid A, where PE represents a phosphoethanolamine group, LD-Hep represents L-glycero-D-manno-heptose, and Kdo represents 3-deoxy-D-manno-oct-2-ulosonic acid. This structural analysis identifies the activity of HP1191 as a heptosyltransferase and a waaF homolog. In vitro invasion assays using human cultured gastric adenocarcinoma cells as a host cell model confirmed that the level of invasion was unaffected for an H. pylori HP1191::Kan deep-rough mutant strain compared with the wild-type strain 26695 expressing the O-chain polysaccharide, providing evidence that LPS is not a critical factor for invasion.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».