MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1993933934 · doi:10.1074/jbc.m201195200

Characterization of New Cell Permeable C3-like Proteins That Inactivate Rho and Stimulate Neurite Outgrowth on Inhibitory Substrates

2002· article· en· W1993933934 sur OpenAlexafffund
Matthew J. Winton, Catherine Dubreuil, Dana D. Lasko, Nicole Leclerc, Lisa McKerracher

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuriteCell biologyInhibitory postsynaptic potentialGrowth coneImmunocytochemistryFusion proteinCell cultureChemistryRecombinant DNABiologyMolecular biologyBiochemistryIn vitroAxonNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The activation state of Rho is an important determinant of axon growth and regeneration in neurons. Axons can extend neurites on growth inhibitory substrates when Rho is inactivated by C3-ADP-ribosyltransferase (C3). We found by Rho-GTP pull-down assay that inhibitory substrates activate Rho. To inactivate Rho, scrape-loading of C3 was necessary because it does not freely enter cells. To overcome the poor permeability of C3, we made and characterized five new recombinant C3-like chimeric proteins designed to cross the cell membrane by receptor-independent mechanisms. These proteins were constructed by the addition of short transport peptides to the carboxyl-terminal of C3 and tested using a bioassay measuring neurite outgrowth of PC-12 cells plated on growth inhibitory substrates. All five constructs stimulated neurite outgrowth but with different dose-response profiles. Biochemical properties of the chimeric proteins were examined using C3-05, the most effective construct tested. Gel shift assays showed that C3-05 retained the ability to ADP-ribosylate Rho. Western blots and immunocytochemistry were used to verify the presence of C3 inside treated cells. C3-05 was also effective at promoting neurite outgrowth in primary neuronal cultures, as well as causing the disassembly of actin stress fibers and focal adhesions complexes in fibroblasts. These studies demonstrate that the new C3-like proteins are effective in delivering biologically active C3 into different cell types, thereby, inactivating Rho.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations128
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetSignaling Pathways in DiseaseTravaux en français237 207