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Enregistrement W1993962364 · doi:10.1074/jbc.m112.350447

Hyaluronidase 1 and β-Hexosaminidase Have Redundant Functions in Hyaluronan and Chondroitin Sulfate Degradation

2012· article· en· W1993962364 sur OpenAlexafffund
Lara Gushulak, Richard Hemming, Dianna C. Martin, Volkan Seyrantepe, Alexey V. Pshezhetsky, Barbara L. Triggs‐Raine

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHospital for Sick ChildrenCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiochemistryChondroitin sulfateHexosaminidaseHyaluronidaseChondroitinGlycosaminoglycanChemistryEnzymeSulfatase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyaluronan (HA), a member of the glycosaminoglycan (GAG) family, is a critical component of the extracellular matrix. A model for HA degradation that invokes the activity of both hyaluronidases and exoglycosidases has been advanced. However, no in vivo studies have been done to determine the extent to which these enzymes contribute to HA breakdown. Herein, we used mouse models to investigate the contributions of the endoglycosidase HYAL1 and the exoglycosidase β-hexosaminidase to the lysosomal degradation of HA. We employed histochemistry and fluorophore-assisted carbohydrate electrophoresis to determine the degree of HA accumulation in mice deficient in one or both enzyme activities. Global HA accumulation was present in mice deficient in both enzymes, with the highest levels found in the lymph node and liver. Chondroitin, a GAG similar in structure to HA, also broadly accumulated in mice deficient in both enzymes. Accumulation of chondroitin sulfate derivatives was detected in mice deficient in both enzymes, as well as in β-hexosaminidase-deficient mice, indicating that both enzymes play a significant role in chondroitin sulfate breakdown. Extensive accumulation of HA and chondroitin when both enzymes are lacking was not observed in mice deficient in only one of these enzymes, suggesting that HYAL1 and β-hexosaminidase are functionally redundant in HA and chondroitin breakdown. Furthermore, accumulation of sulfated chondroitin in tissues provides in vivo evidence that both HYAL1 and β-hexosaminidase cleave chondroitin sulfate, but it is a preferred substrate for β-hexosaminidase. These studies provide in vivo evidence to support and extend existing knowledge of GAG breakdown.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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