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Enregistrement W1994008524 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-lb-117

Abstract LB-117: Myc phosphorylation suppresses transformation through novel regulatory regions.

2013· article· en· W1994008524 sur OpenAlexaff
Dharmendra Dingar, Amanda R. Wasylishen, Michelle Chan‐Seng‐Yue, Ling Huang, Christina Bros, William B. Tu, Natalie Meyer, Paul C. Boutros, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarcinogenesisGeneBiologyTranscription factorMutantPhosphorylationPromoterGene expressionTranscription (linguistics)Cancer researchRegulation of gene expressionCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Myc is a proto-oncogenic transcription factor, whose expression is deregulated in numerous human tumours and over-expression in animal models can cause tumorigenesis. Myc is important in cancer initiation and progression and therefore to develop successful approaches targeting Myc, a better understanding of both the mechanisms of Myc regulation and subsequent deregulation in cancer is important. Identification of Myc post-translational modifications (PTMs) that are essential for its oncogenic activity remains largely unknown. Therefore, detecting those key PTMs and there effect on gene expression would shed more light on the mechanisms of Myc dependent tumorigenesis. In our study, we screened a panel of Myc phosphorylation mutants in MCF10A cells for their ability to promote anchorage-independent colony growth and we identified two previously uncharacterized mutants that increased Myc-dependent transformation: S71A/S81A and 340Cl-A (T343A, S344A, S347A, and S348A). We further confirmed that gain-of-function serine and threonine mutants potentiated transformation in SH-EP neuroblastoma cells and three-dimensional MCF10A acini. Additionally, to investigate the mechanism of increased transformation and mutants' selectivity for gene transcription, we conducted genome-wide mRNA expression analysis of MCF10A acini and identified 112 genes regulated by all MYC alleles, and 158 genes regulated by all three transforming phosphorylation mutants but not wild-type MYC. We performed genome-wide ChIP in MCF10A cells, integrated this with gene transcription data, and showed that the majority of genes with altered expression also have MYC binding in their promoter regions, further suggesting that these gene expression changes are directly regulated by Myc. In conclusion, phosphorylation of S71/S81 and 340Cl amino acid residues negatively regulates Myc dependent transformation, suggesting that better understanding of Myc regulation through the phosphorylation of these residues may provide opportunities to therapeutically target Myc. Citation Format: Dharmendra Dingar, Amanda R. Wasylishen, Michelle Chan-Seng-Yue, Ling Huang, Christina Bros, William Tu, Natalie Meyer, Paul C. Boutros, Linda Z. Penn. Myc phosphorylation suppresses transformation through novel regulatory regions. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr LB-117. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-LB-117

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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