Strand Cleavage of Supercoiled DNA by Water-Soluble Peroxyl Radicals. The Overlooked Importance of Peroxyl Radical Charge
Notice bibliographique
Résumé
It is well established that the peroxyl radicals formed during the thermal decomposition of 2,2'-azobis(amidinopropane), ABAP, in oxygenated water can cleave double-stranded DNA, from which fact it has been concluded that peroxyl radicals, as a general class, can induce DNA strand scission. However, the ABAP-derived radicals are positively charged, and DNA is a negatively charged polyanion. Moreover, the relatively small and, therefore, free to diffuse peroxyl radicals likely to be formed in vivo will generally be negatively charged or neutral. Plasmid supercoiled DNA [pBR 322, 4361 base pairs (bp)] was reacted with known, equal fluxes of two positively charged peroxyl radicals, a negatively charged peroxyl radical, and a neutral peroxyl radical. The two positively charged peroxyl radicals degraded >/=80% of the supercoiled pBR 322 at a flux of 4 radicals/bp, but the negatively charged and neutral peroxyl radicals had no significant effect even at a flux as high as 24 radicals/bp. The same lack of effect on the DNA was also observed with high fluxes of superoxide/hydroperoxyl radicals. Similar results were obtained with another supercoiled DNA, pUC 19, except that pUC 19 is somewhat more sensitive to strand scission by positively charged peroxyl radicals than pBR 322. We conclude that most of the peroxyl radicals likely to be formed in vivo have little or no ability to induce DNA strand scission and that the potential role of electrostatics in radical/DNA reactions should always be considered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».