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Enregistrement W1994200517 · doi:10.1074/jbc.m111.288449

Ataxin-3 Deubiquitination Is Coupled to Parkin Ubiquitination via E2 Ubiquitin-conjugating Enzyme

2011· article· en· W1994200517 sur OpenAlexafffund
Thomas M. Durcan, Maria Kontogiannea, Nathalie Bédard, Simon S. Wing, Edward A. Fon

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Ataxia FoundationParkinson's Disease Foundation
Mots-clésParkinUbiquitinDeubiquitinating enzymeUbiquitin-conjugating enzymeUbiquitin-Protein LigasesChemistryEnzymeCell biologyUbiquitin ligaseBiochemistryBiologyGeneMedicineParkinson's disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We reported previously that parkin, a Parkinson disease-associated E3 ubiquitin-ligase interacts with ataxin-3, a deubiquitinating enzyme associated with Machado-Joseph disease. Ataxin-3 was found to counteract parkin self-ubiquitination both in vitro and in cells. Moreover, ataxin-3-dependent deubiquitination of parkin required the catalytic cysteine 14 in ataxin-3, although the precise mechanism remained unclear. We report here that ataxin-3 interferes with the attachment of ubiquitin (Ub) onto parkin in real-time during conjugation but is unable to hydrolyze previously assembled parkin-Ub conjugates. The mechanism involves an ataxin-3-dependent stabilization of the complex between parkin and the E2 Ub-conjugating enzyme, which impedes the efficient charging of the E2 with Ub. Moreover, within this complex, the transfer of Ub from the E2 is diverted away from parkin and onto ataxin-3, further explaining how ataxin-3 deubiquitination is coupled to parkin ubiquitination. Taken together, our findings reveal an unexpected convergence upon the E2 Ub-conjugating enzyme in the regulation of an E3/deubiquitinating enzyme pair, with important implications for the function of parkin and ataxin-3, two proteins responsible for closely related neurodegenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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