The Human Orthologue of a Novel Apoptosis Response Gene Induced During Rat Myelomonocytic Stem Cell Apoptosis Maps to 20q13.12
Notice bibliographique
Résumé
Stem cell factor (SCF) stimulation of the receptor tyrosine kinase c-kit has effects on the proliferation, differentiation, and apoptotic regulation of hematopoietic progenitor cell populations. Rat bone marrow myelomonocytic stem cells (MSC) isolated in vitro by wheat germ agglutinin culture exclusively undergo self-renewal divisions when stimulated by SCF but bipotentially differentiate in the presence of dexamethasone or 1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3) to granulocytes and macrophages, respectively. We show here that withdrawal of SCF from MSC induces rapid apoptosis in all stages of the cell cycle accompanied by development of an ultrastructural apoptotic morphology. To investigate immediate-early gene induction during MSC apoptosis, a differential display polymerase chain reaction (DD-PCR) screen coupled with rapid amplification of cDNA ends (RACE) PCR was performed. An immediate-early apoptosis response gene was isolated from growth factor-deprived MSC that was not expressed during self-renewal or differentiation induction cultures containing SCF. The protein contains a PEST region enriched in proline, glutamic acid, serine, and threonine residues common to proteins with a high turnover and has a cytoplasmic, vesicular localization in apoptotic MSC shown by immunohistochemistry. The human orthologous gene, isolated by RACE PCR, shows 86% homology to the rat protein and high similarity with a human uncharacterized hypothalamus predicted protein (HSMNP1) localized to the long arm of chromosome 20. Because deletions in this region are a common occurrence in a wide range of myeloproliferative disorders characterized by treatment resistance to apoptosis, HSMNP1 expression may play a role in normal and pathological myeloid development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».