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Enregistrement W1994522607 · doi:10.5376/mpb.2013.04.0011

Cross Species Amplification of Adzukibean Derived Microsatellite Loci and Diversity Analysis in Greengram and Related <i>Vigna</i> Species

2013· article· en· W1994522607 sur OpenAlexvenueno aff
M. Sathya, P. Jayamani

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAgricultural pest management studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVignaMicrosatelliteGenetic diversityGeneticsEvolutionary biologyBotanyAlleleGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Greengram or mungbean ( Vigna radiata (L.) Wilczek) is a well known grain legume in Asian countries. Among the different DNA markers, microsatellite or simple sequence repeats (SSRs) are the markers of choice for various genetic studies due to co-dominant nature, loci specificity and high reproducibility. In the present study, a set of thirty-five microsatellite primer pairs derived from adzukibean ( Vigna angularis (Willd.) Ohwi & Ohashi) were used to assess the transferability and tested for their ability to amplify microsatellite loci in greengram and related Vigna species. Of the thirty five microsatellite markers, thirty-two were successfully amplified across the thirty six genotypes and twenty eight were polymorphic. A total of 83 microsatellite alleles were generated with an average of 2.96 alleles per locus. Number of alleles ranged from two to five. Dendrogram formed based on UPGMA, 36 genotypes were grouped into five clusters. Similarly, the neighbour-joining tree developed based on weighted average for dissimilarity matrix grouped 36 genotypes into five groups. The finding suggests that adzukibean derived microsatellite markers are highly informative and could be used to improve the greengram at molecular level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,847
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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