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Enregistrement W1994604361 · doi:10.1042/bj20130642

Collagen XXII binds to collagen-binding integrins via the novel motifs GLQGER and GFKGER

2014· article· en· W1994604361 sur OpenAlexaff
Daniela Zwolanek, Guido Veit, Johannes A. Eble, Donald Gullberg, Florence Ruggiero, Jyrki Heino, Markus Meier, Jörg Stetefeld, Manuel Koch

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntegrinCollagen receptorRGD motifBinding siteChemistrySurface plasmon resonanceDisintegrinCell biologyReceptorBiologyBiochemistryMaterials scienceNanotechnologyMetalloproteinaseMatrix metalloproteinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Collagen XXII, a FACIT (fibril-associated collagen with interrupted triple helices), is expressed at the myotendinous junction and the articular surface of joint cartilage. Cellular receptors like collagen-binding integrins are known to bind collagens with distinct binding motifs following the sequence GXOGER. In the present study, we demonstrate the sequences GLQGER and GFKGER as novel binding motifs between collagen XXII and collagen-binding integrins, especially α2β1 integrin. Solid-phase assays and surface plasmon resonance spectroscopy revealed a direct interaction between α2β1 integrin and the motif GFKGER. In addition, immunohistochemical analysis demonstrated partial co-localization of collagen XXII, α2β1 integrin and α11β1 integrin at the myotendinous junction. Furthermore, computational modelling of the motifs GLQGER and GFKGER showed perfect fitting of the sequences into the binding pocket of collagen-binding integrins. Taken together, we demonstrated that collagen XXII interacts with collagen-binding integrins via the new motifs GLQGER and GFKGER.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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