The Functions of Mediator in Candida albicans Support a Role in Shaping Species-Specific Gene Expression
Notice bibliographique
Résumé
The Mediator complex is an essential co-regulator of RNA polymerase II that is conserved throughout eukaryotes. Here we present the first study of Mediator in the pathogenic fungus Candida albicans. We focused on the Middle domain subunit Med31, the Head domain subunit Med20, and Srb9/Med13 from the Kinase domain. The C. albicans Mediator shares some roles with model yeasts Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe, such as functions in the response to certain stresses and the role of Med31 in the expression of genes regulated by the activator Ace2. The C. albicans Mediator also has additional roles in the transcription of genes associated with virulence, for example genes related to morphogenesis and gene families enriched in pathogens, such as the ALS adhesins. Consistently, Med31, Med20, and Srb9/Med13 contribute to key virulence attributes of C. albicans, filamentation, and biofilm formation; and ALS1 is a biologically relevant target of Med31 for development of biofilms. Furthermore, Med31 affects virulence of C. albicans in the worm infection model. We present evidence that the roles of Med31 and Srb9/Med13 in the expression of the genes encoding cell wall adhesins are different between S. cerevisiae and C. albicans: they are repressors of the FLO genes in S. cerevisiae and are activators of the ALS genes in C. albicans. This suggests that Mediator subunits regulate adhesion in a distinct manner between these two distantly related fungal species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».