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Enregistrement W1994810229 · doi:10.1021/bi048645p

Solution Structure of Cryptdin-4, a Mouse Paneth Cell α-Defensin<sup>,</sup>

2004· article· en· W1994810229 sur OpenAlexafffund
Weiguo Jing, Howard N. Hunter, Hiroki Tanabe, André J. Ouellette, Hans J. Vogel

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesAlberta Heritage Foundation for Medical Research
Mots-clésAntiparallel (mathematics)ChemistryDefensinCysteineAmino acidAntimicrobial peptidesPeptide sequenceProtein primary structureStereochemistryPeptideBiochemistryEnzymeGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian defensins are abundant antimicrobial peptides that contribute to host defense. They are characterized by several conserved amino acids, including six invariant cysteine residues which form three intramolecular disulfide bonds and stabilize the tertiary structure. Cryptdin-4 (Crp4), a mouse alpha-defensin with potent in vitro bactericidal activity, has a primary structure distinct from all known alpha-defensins in that its polypeptide backbone uniquely lacks three residues between Cys(IV) and Cys(V). NMR diffusion experiments showed that Crp4 is monomeric in solution, and its three-dimensional solution structure, determined by two-dimensional proton NMR, consists of a triple-stranded antiparallel beta-sheet with the beta-strands joined to each other by a series of tight turns and a beta-hairpin. However, the overall beta-sheet content in Crp4 is lower than that of other alpha-defensin structures, while the shape and orientation of the Crp4 beta-hairpin also differ from those of other alpha-defensin structures. These structural characteristics combined with the high overall cationicity of Crp4 may contribute to its broad bactericidal spectrum and membrane disruptive activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,683

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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