MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1994939223 · doi:10.1094/pdis-01-14-0041-pdn

Pseudomonas Blight Caused by <i>Pseudomonas syringae</i> on Raspberry in California

2014· article· en· W1994939223 sur OpenAlexaboutno aff
S. T. Koike, Mark Bolda, Carolee T. Bull

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPseudomonas syringaeNutrient agarBotanyAgarBlightPetiole (insect anatomy)HorticulturePhytoplasmaInoculationLeaf spotMicrobiologyBacteriaRestriction fragment length polymorphismPolymerase chain reactionPathogenGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In February 2013 in coastal California (Santa Cruz County), plantings of red raspberry (Rubus idaeus var. strigosus) exhibited symptoms of a previously undocumented disease. Initial symptoms were small (less than 5 mm wide), angular, water-soaked lesions on leaf and petiole tissues of recently emerged foliage. Lesions were observable from both adaxial and abaxial leaf surfaces. As disease progressed, lesions enlarged and coalesced, resulting in significant dark brown to black blighting of the foliage. The foliage of severely affected plants was stunted and wilted. The disease affected 5 ha and incidence was approximately 30%. Cream-colored bacterial colonies were isolated from surface disinfested symptomatic tissue that was macerated and streaked onto King's medium B (KMB) and sucrose peptone agar (SPA). Fungi were not recovered from any tissue that was surface disinfested and placed into acidified potato dextrose agar. Four representative strains were fluorescent on KMB and gram-negative based on lysis by KOH. Strains were positive for levan formation, negative for oxidase and arginine dihydrolase, and did not cause soft rot on potato slices but induced a hypersensitive response in tobacco (Nicotiana tabacum L. cv. Samsun); strains thus belonged to Lelliot's LOPAT group 1, P. syringae (3). All four strains had identical DNA fragment-banding patterns generated by repetitive extragenic palindromic sequence (rep)-PCR using the BOXA1R primer (4). The pattern generated was different than all P. syringae pathovars in genomospecies 1 including P. syringae pv. syringae. According to multilocus sequence analysis conducted by previously described methods, the strains are most closely related to P. syringae pv. aceris and P. syringae pv. solidagae in genomospecies 1 (1). Potted raspberry plants were used to test four strains for pathogenicity. Inoculum was prepared by growing the bacteria on SPA for 48 h and suspending the bacteria in sterile distilled water (SDW) for a final concentration of approximately 10 7 CFU/ml. Suspensions were sprayed until runoff onto three replicate plants per strain. Control plants were sprayed with SDW until runoff. Plants were enclosed in plastic bags for 24 h and then maintained in a greenhouse (23 to 25°C). After 7 to 8 days, water soaked lesions developed on all inoculated plants; lesions later turned dark brown and appeared similar to symptoms observed in the field. Plants treated with water developed no symptoms. Bacteria re-isolated onto KMB from symptomatic tissues were fluorescent and appeared identical to the bacteria used to inoculate the plants; two selected re-isolated strains were identical to the original strains according to rep-PCR, fluorescence, and LOPAT reactions. The experiment was repeated and disease development and recovery of fluorescent strains on KMB was identical to the first experiment. To our knowledge, this is the first report of Pseudomonas blight of raspberry, caused by P. syringae, in California. Affected plants initially were stunted in growth but later in the summer exhibited no lasting effects from the disease. Pseudomonas blight has been reported in the Pacific Northwest region of the United States, the British Columbia region of Canada, and Serbia (2). References: (1) C. T. Bull et al. Phytopathology 101:847, 2011. (2) Z. Ivanovic et al. Eur. J. Plant Pathol. 134:191, 2012. (3) R. A. Lelliott. J. Appl. Bacteriol. 29:470, 1966. (4) A. S. A. Marques, et al. Genet. Mol. Biol. 31:106. 2008.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,823
Score d'incertitude au seuil0,517

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePlant DiseaseMême sujetPlant Pathogenic Bacteria StudiesTravaux en français237 207