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Enregistrement W1994944007 · doi:10.1021/op990095t

The Dimethoxytrityl Resin Product Anchored Sequential Synthesis Method (DMT PASS):  A Conceptually Novel Approach to Oligonucleotide Synthesis

2000· article· en· W1994944007 sur OpenAlexaff
Jeffery C. Mihaichuk, T. Brian Hurley, Kurt Vagle, Randall S. Smith, John A. Yegge, Gretchen M. Pratt, Christopher J. Tompkins, David P. Sebesta, Wolfgang A. Pieken

Notice bibliographique

RevueOrganic Process Research & Development · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensCanadian Parks and Wilderness Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOligonucleotideOligonucleotide synthesisCombinatorial chemistryChemistryProcess developmentProcess (computing)Computer scienceProcess engineeringDNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Presented is a conceptually novel approach to oligonucleotide synthesis referred to herein as dimethoxytrityl resin product anchored sequential synthesis (DMT PASS). The DMT PASS process is characterized by the reaction of a 3‘-protected nucleoside or oligonucleotide with an excess of a nucleotide 3‘-phosphoramite or H -phosphonate which is bound to a dimethoxytrityl functionalized polystyrene resin. As a result, successfully coupled oligonucleotide product is then attached to the solid support, allowing for removal and potential recovery of starting materials. The protected oligonucleotide product is then released and subjected to an aqueous/organic extractive purification, which serves to remove monomeric impurities. The PASS process is anticipated to provide for the cost-effective manufacture of oligonucleotides on a scale which would allow for clinical development and pharmaceutical product commercialization. Herein we describe some aspects of our process development progress and discuss preliminary applications of the process to the synthesis of short oligodeoxyribonucleotide sequences, as well as a number of challenges confronting the PASS development effort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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