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Enregistrement W1994952696 · doi:10.1158/1538-7445.am2011-1442

Abstract 1442: Expression of miRNA processing factor Dicer in cutaneous melanoma and its role in cell invasion

2011· article· en· W1994952696 sur OpenAlexaff
Seyed Mehdi Jafarnejad, Mazyar Ghaffari, Magdalena Martinka, Michael Cox, Gang Li

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDicerTissue microarrayMelanomamicroRNAGene knockdownCancer researchCancerPathologyDroshaBiologyMedicineMetastasisImmunohistochemistrySmall interfering RNACell cultureInternal medicineRNA interferenceGeneTransfectionGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Deregulated expression of miRNAs is a hallmark of various human cancers. One potential mechanism for the aberrant expression of miRNAs in cancers is their abnormal processing due to altered expression or function of their processing factors such as Dicer and Drosha. Although altered expression of several miRNAs have been reported in melanoma, the expression profile of miRNA processing factors in this cancer is unknown. In this study we examined the expression of Dicer protein in different stages of melanocytic lesions. Using tissue microarray and immunohistochemistry, we evaluated cytoplasmic Dicer expression in 32 dysplastic nevi, 77 primary melanomas, and 48 metastatic melanomas. Our data revealed that expression of Dicer has a significant but inverse correlation with progression of melanoma (P < 0.001). Accordingly, the number of samples with moderate-strong staining for Dicer was reduced from 81.2% in dysplastic nevi to 67.5% in primary melanoma and 40.8% in metastatic melanoma. The expression of Dicer was also negatively correlated with the American Joint Committee on Cancer (AJCC) staging of the melanoma samples (p=0.019). Moreover, the reduced Dicer expression was correlated with a poorer disease-specific 5-year survival of melanoma patients (P = 0.026). Multivariate Cox regression analysis revealed that reduced nuclear Dicer expression is an independent prognostic factor to predict patient outcome (P = 0.030). We also knocked down Dicer expression and used Boyden chamber migration assay to study its role in the invasion ability of MMRU human melanoma cells. Interestingly, knockdown of Dicer enhanced the invasion ability of MMRU cells by 2-fold. Our results demonstrate the critical role of miRNA machinery in the progression of melanoma, suggesting that Dicer may be a suitable prognostic marker for human melanoma patients as well as a potential therapeutic target. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 1442. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-1442

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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