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Enregistrement W1995058453 · doi:10.1158/1535-7163.targ-09-a189

Abstract A189: Expression of fusion proteins in acute myeloid leukemia cells increases sensitivity to histone deacetylase inhibitors

2009· article· en· W1995058453 sur OpenAlexaff
Luca A. Petruccelli, Filippa Pettersson, Daphné Dupéré-Richer, Kim L. Rice, Jonathan D. Licht, Wilson H. Miller

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDNA damageDNA repairVorinostatCancer researchCell biologyFusion proteinHistoneGene silencingMyeloid leukemiaHistone deacetylaseMolecular biologyGeneticsGeneDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Acute Myeloid Leukemias (AMLs) are often characterized by chromosomal rearrangements that result in fusion proteins with aberrant transcriptional regulatory activities. These fusion proteins bind to gene promoters and recruit corepressors such as histone deacetylases (HDACs), which remodel chromatin into a closed conformation thereby silencing genes and contributing to a malignant phenotype. Aberrantly silenced genes include tumor suppressor and pro-differentiation genes. In addition, multiple groups have reported a DNA repair deficient phenotype concurrent with the expression of different fusion proteins in leukemia. Small molecule HDAC inhibitors (HDACi) were devised as a strategy to reverse transcriptional repression. Indeed, many studies have demonstrated the ability of HDACi to re-sensitize leukemic cells to differentiating stimuli. However, other studies have revealed alternate methods by which HDACi exert anti-tumor activity, including induction of apoptosis that may be dependent on induction of ROS, MAPK signaling etc. We find that low doses of HDACi, including Vorinostat and LBH589, induce cell death in the AML cell line U937 in a dose and time-dependant manner. Further, Vorinostat induced cell death in U937 cells is preceded by DNA damage and a G2/M arrest. This correlates with reports that HDACi repress DNA repair, by down-regulating DNA repair genes and by acetylating repair proteins thereby impairing their repair function. Due to the inhibitory effect of leukemic fusion proteins on DNA repair, we predicted that DNA damage induced by HDACi, and thus cell death, would be amplified in AML cells expressing PML-RARα and PLZF-RARα fusion proteins. Sensitivity to Vorinostat and LBH589 was tested in three U937 derived cell lines: PR9 (PML-RARα inducible), B412 (PLZF-RARα inducible) and SN4 (mock transfected control). Indeed, induction of PLZF-RARα increased sensitivity of B412 cells to both Vorinostat- and LBH-mediated cell death. Assaying for DNA damage using alkaline comet assay, PR9 and B412 cells displayed an increase in DNA damage when their respective fusion protein is expressed. Nonetheless, the contribution of DNA damage to HDACi-mediated cell death remains unclear and further study is necessary. These findings are significant as they point to fusion protein expressing AMLs as a target group that may respond better to HDACi-based therapies. Citation Information: Mol Cancer Ther 2009;8(12 Suppl):A189.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
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