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Enregistrement W1995092818 · doi:10.1210/en.2012-1380

The p400/Brd8 Chromatin Remodeling Complex Promotes Adipogenesis by Incorporating Histone Variant H2A.Z at PPARγ Target Genes

2012· article· en· W1995092818 sur OpenAlexafffund
Jean-Philippe Couture, Guylaine Nolet, Élaine Beaulieu, Richard Blouin, Nicolas Gévry

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de Genève
Mots-clésAdipogenesisChromatin immunoprecipitationGene knockdownChromatinHistoneBiologyEpigeneticsCell biologyAdipocyteGene expressionH3K4me3Transcription factorRegulation of gene expressionPeroxisome proliferator-activated receptorGeneChromatin remodelingTranscriptional regulationTranscription (linguistics)Molecular biologyPromoterAdipose tissueGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adipogenesis, the biological process by which preadipocytes differentiate into mature fat cells, is coordinated by a tightly regulated gene expression program. Indeed, it has been reported that a large number of genetic events, from fat cell-specific transcription factors expression, such as the master regulator of fat cell differentiation peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)γ2 to epigenetic modifications, govern the acquisition of a mature adipocyte phenotype. Here, we provide evidence that the E1A-binding protein p400 (p400) complex subunit bromo-containing protein 8 (Brd8) plays an important role in the regulation of PPARγ target genes during adipogenesis by targeting and incorporating the histone variant H2A.Z in transcriptional regulatory regions. The results reported here indicate that expression of both Brd8 and p400 increases during fat cell differentiation. In addition, small hairpin RNA-mediated knockdown of Brd8 or H2A.Z completely abrogated the ability of 3T3-L1 preadipocyte to differentiate into mature adipocyte, as evidenced by a lack of lipid accumulation. Chromatin immunoprecipitation experiments also revealed that the knockdown of Brd8 blocked the accumulation of PPARγ, p400, and RNA polymerase II and prevented the incorporation of H2A.Z at two PPARγ target genes. Taken together, these results indicate that the incorporation of the histone variant H2A.Z at the promoter regions of PPARγ target genes by p400/Brd8 is essential to allow fat cell differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil0,749

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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