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Enregistrement W1995204735 · doi:10.1136/jmedgenet-2014-102703

Novel role for non-homologous end joining in the formation of double minutes in methotrexate-resistant colon cancer cells

2014· article· en· W1995204735 sur OpenAlexafffund
Xiangning Meng, Xiuying Qi, Huanhuan Guo, Mengdi Cai, Chunxiang Li, Jing Zhu, Feng Chen, Huan Guo, Jie Li, Yuzhen Zhao, Peng Liu, Xueyuan Jia, Jingcui Yu, Chunyu Zhang, Wenjing Sun, Yang Yu, Yan Jin, Jing Bai, Ming‐Rong Wang, Jesusa L. Rosales, Ki‐Young Lee, Songbin Fu

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesProgram for Changjiang Scholars and Innovative Research Team in UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaProgram for New Century Excellent Talents in UniversityCanadian Institutes of Health ResearchMinistry of Education of the People's Republic of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésNon-homologous end joiningMolecular biologyGenome instabilityBiologyCancer researchDNACell growthHomologous recombinationChemistryDNA damageBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Gene amplification is a frequent manifestation of genomic instability that plays a role in tumour progression and development of drug resistance. It is manifested cytogenetically as extrachromosomal double minutes (DMs) or intrachromosomal homogeneously staining regions (HSRs). To better understand the molecular mechanism by which HSRs and DMs are formed and how they relate to the development of methotrexate (MTX) resistance, we used two model systems of MTX-resistant HT-29 colon cancer cell lines harbouring amplified DHFR primarily in (i) HSRs and (ii) DMs. RESULTS: In DM-containing cells, we found increased expression of non-homologous end joining (NHEJ) proteins. Depletion or inhibition of DNA-PKcs, a key NHEJ protein, caused decreased DHFR amplification, disappearance of DMs, increased formation of micronuclei or nuclear buds, which correlated with the elimination of DHFR, and increased sensitivity to MTX. These findings indicate for the first time that NHEJ plays a specific role in DM formation, and that increased MTX sensitivity of DM-containing cells depleted of DNA-PKcs results from DHFR elimination. Conversely, in HSR-containing cells, we found no significant change in the expression of NHEJ proteins. Depletion of DNA-PKcs had no effect on DHFR amplification and resulted in only a modest increase in sensitivity to MTX. Interestingly, both DM-containing and HSR-containing cells exhibited decreased proliferation upon DNA-PKcs depletion. CONCLUSIONS: We demonstrate a novel specific role for NHEJ in the formation of DMs, but not HSRs, in MTX-resistant cells, and that NHEJ may be targeted for the treatment of MTX-resistant colon cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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