Predicting Antimicrobial Resistance in Invasive Pneumococcal Infections
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The prevalence of multiantimicrobial resistance among Streptococcus pneumoniae continues to increase worldwide. In patients presenting with infection possibly due to pneumococci, recognition of risk factors that would identify those likely to have an antibiotic-resistant isolate might assist clinicians in choosing the most appropriate empirical therapy. METHODS: A prospective cohort study of invasive pneumococcal infection was conducted in Toronto, Canada. Risk factors for antimicrobial resistance were evaluated by means of univariate and multivariate modeling. RESULTS: A total of 3339 patients with invasive pneumococcal infection were identified between 1995 and 2002. Multivariate modeling revealed that risk factors for infection with penicillin-resistant as opposed to penicillin-susceptible pneumococci were year of infection (odds ratio [OR], 1.28; P < .001), absence of chronic organ system disease (OR, 1.72; P = .03), and previous use of penicillin (OR, 2.47; P = .006), trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX; OR, 5.97; P < .001), and azithromycin (OR, 2.78; P = .05). Infection with TMP-SMX-resistant pneumococci was associated with absence of chronic organ system disease (OR, 1.64; P = .001) and with previous use of penicillin (OR, 1.71; P = .03), TMP-SMX (OR, 4.73; P < .001), and azithromycin (OR, 3.49; P = .001). Infection with macrolide-resistant isolates was associated with previous use of penicillin (OR, 1.77; P = .03), TMP-SMX (OR, 2.07; P = .04), clarithromycin (OR, 3.93; P < .001), and azithromycin (OR, 9.93; P < .001). Infection with fluoroquinolone-resistant pneumococci was associated with previous use of fluoroquinolones (OR, 12.1; P < .001), current residence in a nursing home (OR, 12.9; P < .001), and nosocomial acquisition of pneumococcal infection (OR, 9.94; P = .003). CONCLUSIONS: Knowledge of antimicrobial use during the 3 months before infection is crucial for determining appropriate therapy for a patient presenting to the hospital with an illness for which S. pneumoniae is a possible cause. Nosocomial acquisition and nursing home acquisition are significant risk factors for infection with fluoroquinolone-resistant pneumococci.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».