Jaagsiekte sheep retrovirus detected in human lung cancer tissue arrays
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Adenocarcinoma is the most common type of non-small cell lung cancer and is frequently observed in non-smoking patients. Adenocarcinoma in-situ (formerly referred to as bronchioloalveolar carcinoma) is a subset of lung adenocarcinoma characterized by growth along alveolar septae without evidence of stromal, vascular, or pleural invasion, that disproportionately affects never-smokers, women, and Asians. Adenocarcinoma in-situ is morphologically and histologically similar to a contagious lung neoplasm of sheep called ovine pulmonary adenocarcinoma (OPA). OPA is caused by infection with the exogenous betaretrovirus, jaagsiekte sheep retrovirus (JSRV), whose envelope protein (Env) is a potent oncogene. Several studies have reported that a proportion of human lung adenocarcinomas are immunopositive for an antigen related to the Gag protein of JSRV, however other groups have been unable to verify these observations by PCR. METHODS: Here we examine human lung cancer tissue arrays (TA) for evidence of JSRV Env protein and DNA by immunohistochemical staining and PCR, respectively. RESULTS: Our results reveal that a subset of human lung cancers express an antigen that reacts with a JSRV Env-specific monoclonal antibody in immunohistochemistry and that exogenous JSRV-like env and gag sequences can be amplified from TA tumor samples, albeit inefficiently. CONCLUSIONS: While a causative role has not been established, these data suggest that a JSRV-like virus might infect humans. With next generation sequencing approaches, a JSRV-like virus in human lung cancers may be identified which could have profound implications for prevention, diagnosis and therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».