H2A.Bbd: a quickly evolving hypervariable mammalian histone that destabilizes nucleosomes in an acetylation‐independent way
Notice bibliographique
Résumé
Molecular evolutionary analyses revealed that histone H2A.Bbd is a highly variable quickly evolving mammalian replacement histone variant, in striking contrast to all other histones. At the nucleotide level, this variability appears to be the result of a larger amount of nonsynonymous variation, which affects to a lesser extent, the structural domain of the protein comprising the histone fold. The resulting amino acid sequence diversity can be predicted to affect the internucleosomal and intranucleosomal histone interactions. Our phylogenetic analysis has allowed us to identify several of the residues involved. The biophysical characterization of nucleosomes reconstituted with recombinant mouse H2A.Bbd and their comparison to similar data obtained with human H2A.Bbd clearly support this notion. Despite the high interspecific amino acid sequence variability, all of the H2A.Bbd variants exert similar structural effects at the nucleosome level, which result in an unfolded highly unstable nucleoprotein complex. Such structure resembles that previously described for the highly dynamically acetylated nucleosomes associated with transcriptionally active regions of the genome. Nevertheless, the structure of nucleosome core particles reconstituted from H2A.Bbd is not affected by the presence of a hyperacetylated histone complement. This suggests that replacement by H2A.Bbd provides an alternative mechanism to unfold chromatin structure, possibly in euchromatic regions, in a way that is not dependent on acetylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».