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Enregistrement W1995499474 · doi:10.1109/tsp.2013.2287680

Biosensor Arrays for Estimating Molecular Concentration in Fluid Flows

2013· article· en· W1995499474 sur OpenAlexaff
Maryam Abolfath-Beygi, Vikram Krishnamurthy

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Signal Processing · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiosensorOrdinary differential equationPartial differential equationNonlinear systemDivergence (linguistics)Biological systemMolecular biophysicsFlow (mathematics)Signal processingFluid dynamicsDifferential equationApplied mathematicsMathematicsComputer scienceAlgorithmMathematical analysisChemistryMechanicsPhysicsMaterials scienceDigital signal processingNanotechnologyGeometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This paper constructs dynamical models and signal processing-based estimation algorithms for computing the concentration of target molecules in a fluid flow using an array of biosensors. Each biosensor is constructed out of protein molecules embedded in a synthetic cell membrane. The concentration evolves according to an advection-diffusion partial differential equation, which is coupled with chemical reaction equations on the biosensor surface. By using asymptotic analysis and the divergence theorem, an approximate model is constructed that describes the asymptotic behavior of the concentration as a system of ordinary differential equations. The estimate of target molecule concentration is then obtained by solving a nonlinear least squares problem. Then, explicit expressions are obtained for the variance and bias of the estimate using the derived approximate model. These expressions can evaluate the achievable improvement in the estimate based on the number of biosensors. As an example, the results are illustrated for a novel biosensor built out of protein molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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