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Enregistrement W1995695796 · doi:10.1371/journal.pone.0114777

Association between NME8 Locus Polymorphism and Cognitive Decline, Cerebrospinal Fluid and Neuroimaging Biomarkers in Alzheimer's Disease

2014· article· en· W1995695796 sur OpenAlexfundno aff
Ying Liu, Jin‐Tai Yu, Hui-Fu Wang, Xiaoke Hao, Yufen Yang, Teng Jiang, Xi‐Chen Zhu, Lei Cao, Daoqiang Zhang, Lan Tan

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMinor allele frequencyAtrophyGenotypeNeuroimagingSingle-nucleotide polymorphismAlleleCognitive declineAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeInternal medicineMedicineDementiaCerebrospinal fluidAlzheimer's diseaseGenome-wide association studyPathologyOncologyDiseaseBiologyGeneticsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recently, a large meta-analysis of five genome wide association studies (GWAS) identified a novel locus (rs2718058) adjacent to NME8 that played a preventive role in Alzheimer's disease (AD). However, this link between the single nucleotide polymorphism (SNP) rs2718058 and the pathology of AD have not been mentioned yet. Therefore, this study assessed the strength of association between the NME8 rs2718058 genotypes and AD-related measures including the cerebrospinal fluid (CSF) amyloid beta, tau, P-tau concentrations, neuroimaging biomarkers and cognitive performance, in a large cohort from Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) database. We used information of a total of 719 individuals, including 211 normal cognition (NC), 346 mild cognitive impairment (MCI) and 162 AD. Although we didn't observe a positive relationship between rs2718058 and AD, it was significantly associated with several AD related endophenotypes. Among the normal cognitively normal participants, the minor allele G carriers showed significantly associated with higher CDRSB score than A allele carriers (P = 0.021). Occipital gyrus atrophy were significantly associated with NME8 genotype status (P = 0.002), with A allele carriers has more atrophy than the minor allele G carriers in AD patients; lateral ventricle (both right and left) cerebral metabolic rate for glucose (CMRgl) were significantly associated with NME8 genotype (P < 0.05), with GA genotype had higher metabolism than GG and AA genotypes in MCI group; the atrophic right hippocampus in 18 months is significantly different between the three group, with GG and AA genotypes had more hippocampus atrophy than GA genotypes in the whole group. Together, our results are consistent with the direction of previous research, suggesting that NME8 rs2718058 appears to play a role in lowering the brain neurodegeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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