MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1995750817 · doi:10.1111/j.1365-2958.2009.06757.x

The long‐chain fatty acid sensor, PsrA, modulates the expression of <i>rpoS</i> and the type III secretion <i>exsCEBA</i> operon in <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2009· article· en· W1995750817 sur OpenAlexafffund
V.V. Lunin, T. Skarina, Alexei Savchenko, Michael J. Schurr, Tung T. Hoang

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésrpoSBiologyOperonPseudomonas aeruginosaSecretionType three secretion systemMicrobiologyGeneGeneticsGene expressionBacteriaBiochemistryVirulenceEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pseudomonas aeruginosa PsrA autorepressor has dual roles as a repressor of the fadBA5beta-oxidation operon and an activator of the stationary-phase sigma factor rpoS and exsCEBA operon of the type III secretion system (TTSS). Previously, we demonstrated that the repression of the fadBA5 operon by PsrA is relieved by long-chain fatty acids (LCFAs). However, the signal affecting the activation of rpoS and exsC via PsrA is unknown. In this study, microarray and gene fusion data suggested that LCFA (e.g. oleate) affected the expression of rpoS and exsC. DNA binding studies confirmed that PsrA binds to the rpoS and exsC promoter regions. This binding was inhibited by LCFA, indicating that LCFA directly affects the activation of these two genes through PsrA. LCFA decreased rpoS and exsC expression, resulting in increased N-(butyryl)-l-homoserine-lactone quorum sensing signal and decreased ExoS/T production respectively. Based on the crystal structure of PsrA, site-directed mutagenesis of amino acid residues, within the hydrophobic channel thought to accommodate LCFA, created two LCFA-non-responsive PsrA mutants. The binding and activation of rpoS and exsC by these PsrA mutants was no longer inhibited by LCFA. These data support a mechanistic model where LCFAs influence PsrA regulation to control LCFA metabolism and some virulence genes in P. aeruginosa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,551

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular MicrobiologyMême sujetVibrio bacteria research studiesTravaux en français237 207