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Enregistrement W1995802657 · doi:10.1002/bip.20299

Fourier transform infrared/vibrational circular dichroism spectroscopy as an informative tool for the investigation of large supramolecular complexes of biological macromolecules

2005· article· en· W1995802657 sur OpenAlex
A. M. Polyanichko, H. Wieser

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCircular dichroismDNAMacromoleculeCrystallographySupramolecular chemistryInfrared spectroscopyPhotochemistryBiophysicsBiochemistryOrganic chemistryCrystal structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A combination of ultraviolet (UV) and infrared (IR) absorption and circular dichroism (CD) spectroscopy was applied to investigate the structure and formation of large supramolecular DNA–protein complexes. This combination of techniques was used to overcome limitations of UV‐CD (electronic, or ECD) spectroscopy due to considerable light scattering in such solutions. Based on the analysis of FTIR and UV‐CD spectra, the interaction of DNA with nonhistone chromatin protein HMGB1 and linker histone H1 was studied. The data obtained showed that under the conditions of the experiment (15 m M NaCl, protein/DNA ratio r < 1 w/w) the proteins did not reveal any AT or GC specificity in binding to DNA. In the presence of both proteins, mainly interactions in the DNA minor groove were observed, which were attributed to HMGB1 binding. Histone H1 facilitated binding of HMGB1 to DNA by interacting with the negatively charged groups of the sugar–phosphate backbone and binding of aspartic and glutamic amino acid residues of HMGB1. Acting together, HMGB1 and H1 stimulated the assemblage of supramolecular DNA–protein structures. The structural organization of the ternary complexes depended not only on the properties of the protein–DNA interactions but also on the interactions between HMGB1 and H1 molecules. © 2005 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers 78: 329–339, 2005 This article was originally published online as an accepted preprint. The “Published Online” date corresponds to the preprint version. You can request a copy of the preprint by emailing the Biopolymers editorial office at biopolymers@wiley.com

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle