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Enregistrement W1995860488 · doi:10.1371/journal.pntd.0003662

Treponema pallidum subsp. pallidum TP0136 Protein Is Heterogeneous among Isolates and Binds Cellular and Plasma Fibronectin via its NH2-Terminal End

2015· article· en· W1995860488 sur OpenAlexfundno aff
Wujian Ke, Barbara J. Molini, Sheila A. Lukehart, Lorenzo Giacani

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSyphilis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of VictoriaAmerican Sexually Transmitted Diseases AssociationNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesSouthern Medical UniversityUniversity of Kansas
Mots-clésTreponemaBacterial adhesinBiologyFibronectinRecombinant DNAMicrobiologyImmune systemPlasma protein bindingExtracellular matrixPathogenBinding proteinVirologySyphilisCell biologyVirulenceImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adherence-mediated colonization plays an important role in pathogenesis of microbial infections, particularly those caused by extracellular pathogens responsible for systemic diseases, such as Treponema pallidum subsp. pallidum (T. pallidum), the agent of syphilis. Among T. pallidum adhesins, TP0136 is known to bind fibronectin (Fn), an important constituent of the host extracellular matrix. To deepen our understanding of the TP0136-Fn interaction dynamics, we used two naturally-occurring sequence variants of the TP0136 protein to investigate which region of the protein is responsible for Fn binding, and whether TP0136 would adhere to human cellular Fn in addition to plasma Fn and super Fn as previously reported. Fn binding assays were performed with recombinant proteins representing the two full-length TP0136 variants and their discrete regions. As a complementary approach, we tested inhibition of T. pallidum binding to Fn by recombinant full-length TP0136 proteins and fragments, as well as by anti-TP0136 immune sera. Our results show that TP0136 adheres more efficiently to cellular Fn than to plasma Fn, that the TP0136 NH2-terminal conserved region of the protein is primarily responsible for binding to plasma Fn but that binding sites for cellular Fn are also present in the protein's central and COOH-terminal regions. Additionally, message quantification studies show that tp0136 is highly transcribed during experimental infection, and that its message level increases in parallel to the host immune pressure on the pathogen, which suggests a possible role for this protein in T. pallidum persistence. In a time where syphilis incidence is high, our data will help in the quest to identify suitable targets for development of a much needed vaccine against this important disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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