A novel interaction of pokeweed antiviral protein with translation initiation factors 4G and iso4G: a potential indirect mechanism to access viral RNAs
Notice bibliographique
Résumé
Pokeweed antiviral protein (PAP) is a ribosome inactivating protein recognized primarily for its ability to depurinate the sarcin/ricin loop of the large rRNA. Studies have demonstrated that PAP also depurinates other RNA templates, such as Human immunodeficiency virus-1 RNA and Brome mosaic virus RNAs. However, the mechanism by which PAP accesses viral RNAs is not known. Considering that PAP was shown recently to bind the m(7)G of the cap structure, we speculated that PAP may interact with other factors involved in translation initiation. By far western analysis, we show that PAP binds specifically to eIF4G and eIFiso4G of wheat germ and analysis with truncation mutants of eIFiso4G indicates that a region of this protein, between amino acids 511 and 624, is required for PAP binding activity. The yeast two-hybrid system supports these results by showing reduced growth and alpha-galactosidase expression with truncation in this region of eIFiso4G. PAP binds m(7)GTP-Sepharose and this interaction does not diminish the binding of PAP to purified eIFiso4G, indicating that a complex can form among the cap structure, PAP and eIFiso4G. We incubated PAP with uncapped and non-polyadenylated transcripts containing a 3' translation enhancer sequence (TE) known to increase translation of the RNA in an eIF4F dependent manner. We show that in the presence of wheat germ lysate, PAP depurinates the uncapped and non-polyadenylated transcripts containing a functional wild-type 3'TE, but does not depurinate messages containing a non-functional mutant 3'TE. These results support our hypothesis that binding of PAP to eIF4G and eIFiso4G can provide a mechanism for PAP to access both uncapped and capped viral RNAs for depurination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».