A phylogeny of the genus <i>Agaricus</i> based on mitochondrial <i>atp</i> 6 sequences
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Notice bibliographique
Résumé
The genus Agaricus includes the most economically-important, commercially-cultivated mushroom in the world, A. bisporus. Effective efforts to improve A. bisporus through breeding will require a greater understanding of the evolutionary relationships between A. bisporus and other Agaricus species. We present here the complete mitochondrial atp6 gene of A. bitorquis and amplified homologues from 9 other species of Agaricus, including 6 different isolates of A. bisporus. Unexpectedly, only 2 variants of atp6 were found among the 6 isolates of A. bisporus, which had been chosen to represent mitochondrial types thought to be highly divergent based on RFLP data. Although interspecific variation was high, parsimony and maximum likelihood analyses resulted in identical phylogenetic trees for the genus: A. bisporus, A. subfloccosus and A. subperonatus were tightly clustered as a single subgroup, whereas the remaining species were highly divergent. The species representatives with the closest proximity to the A. bisporus cluster were A. bitorquis and A. campestris, which is in agreement with published phylogenies derived from nuclear sequence data. Incongruency between this mitochondrial gene-based phylogeny and a phylogeny of linear mitochondrial plasmids found in these same species indicates separate evolutionary histories for the plasmids and their host mitochondria.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle