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Enregistrement W1996138754 · doi:10.1002/gcc.20045

Cryptic insertion of <i>MLL</i> gene into 9p22 leads to <i>MLL–MLLT3</i> (<i>AF9</i>) fusion in a case of acute myelogenous leukemia

2004· article· en· W1996138754 sur OpenAlexaff
Mary Shago, Derek Bouman, Suzanne Kamel‐Reid, Mark D. Minden, Kathy Chun

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity Health NetworkHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusion geneChromosomal translocationMolecular biologyKaryotypeBiologyFusion transcriptMyeloid leukemiaFluorescence in situ hybridizationMetaphaseLeukemiabreakpoint cluster regionChromosomeCancer researchGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The formation of a leukemogenic fusion product in hematopoietic malignancies is commonly achieved by chromosomal translocation. Alternate and cytogenetically undetectable mechanisms of fusion transcript generation have been documented for BCR-AB1, AML1-ETO, PML-RARA, NPM/ALK, and MLL-MLLT2 (AF4). Here, we report the investigation of a cryptic rearrangement leading to MLL-MLLT3 transcript formation. Cytogenetic analysis of peripheral blood from a 50-year-old acute myeloid leukemia patient yielded a karyotype of 47,XY,+8,del(11)(q21q23) in all metaphase cells examined. Metaphase fluorescence in situ hybridization analysis using the MLL probe at 11q23 revealed that the 5' portion of the MLL gene was inserted into chromosome 9 at band p22, whereas the 3' region of the MLL gene remained on chromosome 11. Whole-chromosome paint analysis confirmed the cryptic transfer of chromosome 11 material to 9p22. With this information, the karyotype was reassigned as 47,XY,+8,der(9)ins(9;11)(p22;q23q23),del(11)(q21q23). RT-PCR was used to show that the cryptic rearrangement in this patient led to the fusion of the MLL and MLLT3 transcripts on the der(9). The presence of the MLL-MLLT3 transcript is consistent with the clinical findings in this patient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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