Molecular Phylogenetic Relationships of the Brown Leaf Rust Fungi on Wheat, Rye, and Other Grasses
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Notice bibliographique
Résumé
The classification of brown leaf rust fungi (Puccinia recondita complex and allied species) on wheat (Triticum aestivum), rye (Secale cereale), and other grasses in the family Poaceae has experienced a long history of controversy and uncertainty due to the reduced morphological characteristics available for taxonomy and difficulty of conducting interfertility experiments. However, because these are pathogens on important crops, it is important to clarify the species delimitations reflecting the natural lineages. In this study, phylogenetic analyses were conducted with DNA sequence data from the ribosomal DNA internal transcribed spacer region and elongation factor 1-α to elucidate this species complex. Three phylogenetic lineages were recovered within the complex of rye leaf rust fungi, P. recondita sensu stricto, which is congruent with existing classifications based on DNA content, sexual compatibility, and morphological studies. The brown leaf rust fungus on wheat (P. triticina) grouped with the related species P. persistens on Elymus repens and E. intermedia as a strongly supported clade. Collections on other Elymus spp. were separated into six clades. Based on the phylogenetic affinities of nine type specimens and aecial host associations, potential taxonomic names were evaluated for selected lineages.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle