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Enregistrement W1996177607 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-5281

Abstract 5281: Role of SHP-2 tyrosine phosphatase in colorectal carcinogenesis

2014· article· en· W1996177607 sur OpenAlexaff
J Gagné Sansfaçon, Geneviève Coulombe, Nadia Bourdages, Nathalie Rivard

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer researchMatrigelCarcinogenesisProtein kinase BProtein tyrosine phosphataseCell growthKRASBiologyGene silencingMolecular biologySignal transductionCell biologyColorectal cancerCancerAngiogenesisGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SHP-2 (Src homology-2 domain-containing phosphatase 2) is a tyrosine phosphatase ubiquitously expressed. Previous work done in SHP-2-/- fibroblasts demonstrated its implication in proliferation and migration as well as in the regulation of many signaling pathways including the Ras-Raf/MEK/ERK, the PI3K/AKT and the Jak/STAT pathways(1). Importantly, gain-of-function mutations were discovered in some colorectal cancers (CRCs)(2). However, the role of SHP-2 in intestinal tumorigenesis has never been investigated. Methods: SHP-2 expression and catalytic activity were analyzed by Western blot, qPCR and immunohistochemistry in human CRC cells and in human tumours from different stages. SHP-2 expression was also analyzed in polyps (adenomas) from mice bearing a mutation in Apc gene (APCMin/+ mice). To elucidate the role of SHP-2, RNA interference was used to specifically downregulate its expression in intestinal epithelial cells transformed or not by the oncogenic form of KRASG12V (IEC/KRas). Proliferation (cell counting), invasion (through Matrigel in Boyden chamber), anchorage-independent growth (soft agar) and tumor formation in nude mice (xenograft assays) were analyzed. Results: 1- SHP-2 mRNA and protein levels were significantly increased in human CRC cells and tumors, especially in adenomas, in comparison to healthy adjacent tissues. 2- Interestingly, polyps from APCMin/+ mice also exhibited marked increase in SHP-2 protein expression in comparison to normal adjacent intestinal epithelium. 3- SHP-2 silencing in IEC/KRAS cells markedly reduced their proliferation rate, their growth in soft agar, their capacity to migrate and invade Matrigel and finally, their capacity to form tumor in vivo, in nude mice. 4- Of note, phosphorylated and activated levels of MEK and ERK kinases were significantly decreased following SHP-2 silencing in IECs particularly in those expressing the mutated form of KRAS. Conclusion: Our data suggest that SHP-2 promotes malignancy of intestinal epithelial cells by sustaining the oncogenic activation of MEK/ERK signalling during intestinal tumorigenesis. (1)Shi ZQ, Lu W, Feng GS., J Biol Chem. 1998 Feb 27;273(9):4904-8. (2)Bentires-Alj M. et al., Cancer Res. 2004 Dec 15;64(24):8816-20. Citation Format: Jessica Gagne Sansfacon, Geneviève Coulombe, Nadia Bourdages, Nathalie Rivard. Role of SHP-2 tyrosine phosphatase in colorectal carcinogenesis. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 5281. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-5281

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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