Toward the phylogeny of the family Lacertidae-Why 4708 base pairs of mtDNA sequences cannot draw the picture
Notice bibliographique
Résumé
A phylogeny of the family Lacertidae was derived from DNA sequences of six mitochondrial genes. Only a few nodes were confidently resolved using maximum parsimony, although the data yielded a total of 1664 phylogenetically informative characters. The lacertids grouped into two subfamilies, the Gallotiinae which includes genera Gallotia and Psammodromus, and the Lacertinae which includes the remaining lacertids. The Lacertinae split into two additional groups. The African group included all African and Arabian lacertids and two Eurasian genera, Eremias and Ophisops; the remaining Eurasian lacertids were included in the Eurasian group. Most of the relationships within the African and Eurasian groups cannot be confidently resolved. A permutation tail probability test suggested that there is very little character covariance in the data to support these unresolved relationships. A recent explosive speciation hypothesis was invoked to explain the lack of structure of the data. The common ancestor of the Eurasian group, as well as the ancestor of the African group, experienced simultaneous, or almost simultaneous, multiple speciation events, which left none or very few characters fixed on the intcrnodes. The phylogenetic reconstruction at the family level will be very difficult, if not impossible. Future phylogenetic research should focus on lower levels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».