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Enregistrement W1996208018 · doi:10.1371/journal.pone.0084601

Generalized Linear Mixed Models for Binary Data: Are Matching Results from Penalized Quasi-Likelihood and Numerical Integration Less Biased?

2014· article· en· W1996208018 sur OpenAlexaff
Andrea Benedetti, Robert W. Platt, Juli Atherton

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Bayesian Inference
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalMontreal Heart InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStatisticsQuasi-likelihoodMathematicsGeneralized linear mixed modelLinear regressionGeneralized linear modelBinary dataRandom effects modelBinary numberNegative binomial distributionPoisson distributionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Over time, adaptive Gaussian Hermite quadrature (QUAD) has become the preferred method for estimating generalized linear mixed models with binary outcomes. However, penalized quasi-likelihood (PQL) is still used frequently. In this work, we systematically evaluated whether matching results from PQL and QUAD indicate less bias in estimated regression coefficients and variance parameters via simulation. METHODS: We performed a simulation study in which we varied the size of the data set, probability of the outcome, variance of the random effect, number of clusters and number of subjects per cluster, etc. We estimated bias in the regression coefficients, odds ratios and variance parameters as estimated via PQL and QUAD. We ascertained if similarity of estimated regression coefficients, odds ratios and variance parameters predicted less bias. RESULTS: Overall, we found that the absolute percent bias of the odds ratio estimated via PQL or QUAD increased as the PQL- and QUAD-estimated odds ratios became more discrepant, though results varied markedly depending on the characteristics of the dataset. CONCLUSIONS: Given how markedly results varied depending on data set characteristics, specifying a rule above which indicated biased results proved impossible. This work suggests that comparing results from generalized linear mixed models estimated via PQL and QUAD is a worthwhile exercise for regression coefficients and variance components obtained via QUAD, in situations where PQL is known to give reasonable results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,173
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,510
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,827
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1730,510
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0040,006
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,259
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,103 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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