Identification of dimer interactions required for the catalytic activity of the TRPM7 alpha-kinase domain
Notice bibliographique
Résumé
TRPM7 (transient receptor potential melastatin) combines an ion channel domain with a C-terminal protein kinase domain that belongs to the atypical alpha-kinase family. The TRPM7 alpha-kinase domain assembles into a dimer through the exchange of an N-terminal segment that extends from residue 1551 to residue 1577 [Yamaguchi, Matsushita, Nairn and Kuriyan (2001) Mol. Cell 7, 1047-1057]. Here, we show, by analysis of truncation mutants, that residues 1553-1562 of the N-terminus are essential for kinase activity but not dimer formation. Within this 'activation sequence', site-directed mutagenesis identified Tyr-1553 and Arg-1558 as residues critical for activity. Examination of the TRPM7 kinase domain structure suggests that the activation sequence interacts with the other subunit to help position a catalytic loop that contains the invariant Asp-1765 residue. Residues 1563-1570 of the N-terminal segment are critical for dimer assembly. Mutation of Leu-1564, Ile-1568 or Phe-1570 to alanine abolished both kinase activity and dimer formation. The activity of a monomeric TRPM7 kinase domain lacking the entire N-terminal segment was rescued by a GST (glutathione transferase) fusion protein containing residues 1548-1576 of TRPM7, showing that all interactions essential for activity are provided by the N-terminal segment. Activity was also restored by GST fused to the N-terminal segment of TRPM6 (residues 1711-1740), demonstrating the feasibility of forming functional TRPM6-TRPM7 alpha-kinase domain heterodimers. It is proposed that covalent modifications or binding interactions that alter the conformation of the N-terminal exchanged segment may provide a means to regulate TRPM7 kinase activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».