Polymorphisms of the <i>prion protein</i> gene (<i>PRNP </i>) in Alaskan moose (<i>Alces alces gigas</i>)
Notice bibliographique
Résumé
sion assays on the Sequenom MassArray TM system (San Diego, CA, USA).Analysis of the USMARC swine mapping family resulted in a map assignment of INHA to chromosome 15 at position 88 cM and generated 67 informative meioses in seven families (86 progeny).The STAR marker generated 43 informative meioses and mapped to chromosome 15 at position 61 cM, the same position as microsatellite marker SW1401 on the MARC swine linkage map (http://www.marc.usda.gov/).The T allele at nucleotide 499 was found only in Meishan with a frequency of 0.8.Association of SNPs with ovulation rate or age of puberty: Onequarter of Meishan F 8 gilts (n ¼ 150) that were descendants of the MARC resource population 1 with age at puberty and ovulation rate data were genotyped for the INHA 572G>A and STAR 499G>T polymorphisms.Data were analysed using the GLM procedure of SAS in which sire and maternal grandsire were fitted as fixed effects for age at puberty.The model for ovulation rate also included a fixed effect for method of measuring ovulation rate (laparoscopy versus slaughtered).The frequencies of the rare alleles were 0.32 (X03265:c.572G>A of INHA) and 0.19 (U53020:c.499G>T of STAR) respectively.The INHA and STAR genotypes were not associated with ovulation rate (P ¼ 0.84 and P ¼ 0.95 respectively) or age at puberty (P ¼ 0.32 and P ¼ 0.75 respectively) in this data set.Due to a lack of association of these single nucleotide polymorphism (SNPs) with ovulation rate, we suggest that the linkage disequilibrium between the causative mutation and these genes has been disrupted by recombination in this population, and the gene responsible for the QTL effects on porcine chromosome 15 probably resides some distance away from INHA and STAR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».