Comparison of the structure and organization of the <i>rrna</i> operons of <i>Bouteloua gracilis</i> and <i>Zea mays</i>
Notice bibliographique
Résumé
Aguado-Santacruz, G. A., Betancourt-Guerra, D. A., Siquerios-Cendón, T., Arévalo-Gallegos, S., Rivera-Chavira, B. E., Nevarez-Moorillon, G. V., Moreno-Gómez, B. and Rascón-Cruz, Q. 2011. Comparison of the structure and organization of therrnaoperons of Bouteloua gracilisandZea mays. Can. J. Plant Sci. 91: 107–116. We studied the genomic structure of Bouteloua gracilis chloroplast DNA (cpDNA) and compared it with the sequenced ribosomal RNA spacer region from other cereals. This will allow us to understand chloroplast topology and the recombination ability of cpDNA. The development of potential tools for biotechnology applied to cereals can be focused through the study of cpDNA in family related grasses, such as B. gracilis. cpDNA was prepared from green B. gracilis and Zea mays plants using a modified NaCl method. A 2332 bp intergenic spacer (IGS) region (rrna16S-trnI-trnA-rrna23S) from B. gracilis was sequenced, which showed great similarity (at least 92%) to IGS region from Z. mays, Oryza sativa and Saccharum officinarum. A physical map constructed by Southern hybridization using petA, psbA, psbD, ndhA, rbcL, 16S and 23S rDNA digoxigenin-labelled probes showed low organizational resemblance to maize cpDNA. Moreover, when compared to a similar fragment of Z. mays, a 239 bp intron deletion was found in the trnI gene in the B. gracilis cpDNA. Restriction and hybridization analyses suggested that the B. gracilis cpDNA has a molecular weight of 130 Kb. We expect that the findings reported in this work can be a baseline for increasing our knowledge in chloroplast organization in grasses and for the development of molecular tools.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».