Effects of Exposure to a DNA Damaging Agent on the Hypoxia Inducible Factors in Organogenesis Stage Mouse Limbs
Notice bibliographique
Résumé
Hypoxia plays a critical role in coordinating cell survival, differentiation and death in normal embryogenesis; during limb pattern formation, hypoxia affects two key processes, chondrogenesis and cell death. Hypoxia promotes chondrocyte differentiation and cartilage matrix synthesis and suppresses terminal differentiation. Depending on the context, hypoxia may induce cell cycle arrest, pro- or anti-apoptotic genes, or autophagy. The response to hypoxia is controlled by hypoxia inducible transcription factors, specifically Hif1a, Hif2a and Hif3a. Under normoxia, the hypoxia-inducible factors respond to a variety of stimuli that include several well established teratogens, such as retinoic acid, heavy metals and hyperglycemia. We hypothesize that teratogenic exposures disrupt limb development by altering the hypoxia signalling pathway. To test this hypothesis, we assessed the effects of a DNA damaging alkylating agent, 4-hydroperoxycyclophosphamide, on the hypoxia inducible factor (HIF) transcription factors and on hypoxia in the murine limb bud culture system. 4-Hydroperoxycyclophosphamide exposure increased HIF1 DNA binding activity and HIF1A and HIF2A, but not HIF3A, protein concentrations. HIF1A and HIF2A immunoreactivities were detected in the apical ectodermal ridge and interdigital regions, where cell death sculpts the limb; 4-hydroperoxycyclophosphamide treatment enhanced their immunoreactivities, specifically in these regions. In contrast, hypoxia was localized to areas of chondrogenesis, the cartilaginous anlagen of the developing long bone and phalanges, and was not enhanced by drug exposure. Thus, the exposure of limb buds in vitro to a DNA damaging teratogen triggered a hypoxia signalling response that was associated with cell death. During limb development the HIFs have oxygen-independent functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».