Recombinant Porphyromonas gingivalis FimA preproprotein expressed in Escherichia coli is lipidated and the mature or processed recombinant FimA protein forms a short filament in vitro
Notice bibliographique
Résumé
The gram-negative anaerobic bacterium Porphyromonas gingivalis is an etiologically important pathogen for chronic periodontal diseases in adults. Our previous study suggested that the major structural components of both Fim and Mfa fimbriae in this organism are secreted through their lipidated precursors. In this study, we constructed Escherichia coli strains expressing various fimA genes with or without the 5'-terminal DNA region encoding the signal peptide, and we determined whether lipidation of recombinant FimA proteins occurred in E. coli. Lipidation occurred for a recombinant protein from the fimA gene with the 5'-terminal DNA region encoding the signal peptide but not for a recombinant protein from the fimA gene without the signal-peptide-encoding region, as revealed by [3H]palmitic acid labeling experiments. A TLR2-dependent signaling response was induced by the recombinant protein from the fimA gene with the signal-peptide-encoding region but not by a recombinant protein from the fimA gene with the signal-peptide-encoding region that had a base substitution causing an amino acid substitution (C19A). Electron microscopic analysis revealed that recombinant FimA (A-47 - W-383) protein was autopolymerized to form filamentous structures of about 80 nm in length in vitro. The results suggest that FimA protein, a major subunit of Fim fimbriae, is transported to the outer membrane by the lipoprotein sorting system, and a mature or processed FimA protein on the outer membrane is autopolymerized to form Fim fimbriae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».