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Enregistrement W1996543511 · doi:10.4161/epi.23399

Chromosome X loci and spontaneous granulosa cell tumor development in SWR mice

2013· article· en· W1996543511 sur OpenAlexaff
Ann M. Dorward, Edward S. Yaskowiak, Kerri Smith, Kaitlyn R. Stanford, Kathryn L. Shultz, Wesley G. Beamer

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyPenetranceLocus (genetics)AlleleCongenicGeneticsQuantitative trait locusPhenotypeGeneCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Females of the SWR/Bm (SWR) inbred mouse strain possess a unique susceptibility to juvenile-onset tumors originating from the granulosa cells (GC) of the ovarian follicles. Tumor susceptibility is an inherited, polygenic trait in SWR females, minimally involving an oncogenic Granulosa cell tumor susceptibility (Gct) locus on chromosome (Chr) 4 (Gct1), and two GC tumor susceptibility modifier genes mapped to distinct regions of Chr X (Gct4 and Gct6). Shifts in the frequency of GC tumor initiation in the SWR female population from low penetrance to moderate penetrance, or phenotype switching between GC tumor-susceptible and GC tumor-resistant, is strongly influenced by the allelic contributions at Gct4 and Gct6. In addition to the allele-specific effects, GC tumor susceptibility is controlled by the mode of X-linked transmission with a dominant, paternal parent-of-origin effect. We took advantage of the robust paternal effect with a recombinant male progeny testing strategy to resolve the Gct4 locus interval to 1.345 million base (Mb) pairs. Based on the mapping resolution and the phenotype sensitivity to endogenous and exogenous androgen exposure, a promising candidate for Gct4 identity is the androgen receptor (Ar) gene. We explored the mechanism of allelic variation for Ar between SWR (low penetrance allele) and SJL/Bm (SJL) (moderate penetrance allele) using an SWR.SJL-X congenic strain resource and a quantitative gene expression method. We report the low GC tumor penetrance allele of the SWR strain correlates with significantly reduced Ar transcript levels in the female ovary at the pubertal transition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,714

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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