Chromosome X loci and spontaneous granulosa cell tumor development in SWR mice
Notice bibliographique
Résumé
Females of the SWR/Bm (SWR) inbred mouse strain possess a unique susceptibility to juvenile-onset tumors originating from the granulosa cells (GC) of the ovarian follicles. Tumor susceptibility is an inherited, polygenic trait in SWR females, minimally involving an oncogenic Granulosa cell tumor susceptibility (Gct) locus on chromosome (Chr) 4 (Gct1), and two GC tumor susceptibility modifier genes mapped to distinct regions of Chr X (Gct4 and Gct6). Shifts in the frequency of GC tumor initiation in the SWR female population from low penetrance to moderate penetrance, or phenotype switching between GC tumor-susceptible and GC tumor-resistant, is strongly influenced by the allelic contributions at Gct4 and Gct6. In addition to the allele-specific effects, GC tumor susceptibility is controlled by the mode of X-linked transmission with a dominant, paternal parent-of-origin effect. We took advantage of the robust paternal effect with a recombinant male progeny testing strategy to resolve the Gct4 locus interval to 1.345 million base (Mb) pairs. Based on the mapping resolution and the phenotype sensitivity to endogenous and exogenous androgen exposure, a promising candidate for Gct4 identity is the androgen receptor (Ar) gene. We explored the mechanism of allelic variation for Ar between SWR (low penetrance allele) and SJL/Bm (SJL) (moderate penetrance allele) using an SWR.SJL-X congenic strain resource and a quantitative gene expression method. We report the low GC tumor penetrance allele of the SWR strain correlates with significantly reduced Ar transcript levels in the female ovary at the pubertal transition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».