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Enregistrement W1996600340 · doi:10.1093/nar/gku461

Lessons from miR-143/145: the importance of cell-type localization of miRNAs

2014· review· en· W1996600340 sur OpenAlex
Oliver A. Kent, Matthew N. McCall, Toby C. Cornish, Marc K. Halushka

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesJohns Hopkins University
Mots-clésmicroRNABiologyCarcinogenesisCell typeCellContext (archaeology)Colorectal cancerCancer researchCell biologyRegulation of gene expressionSuppressorCancerComputational biologyBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

miR-143 and miR-145 are co-expressed microRNAs (miRNAs) that have been extensively studied as potential tumor suppressors. These miRNAs are highly expressed in the colon and are consistently reported as being downregulated in colorectal and other cancers. Through regulation of multiple targets, they elicit potent effects on cancer cell growth and tumorigenesis. Importantly, a recent discovery demonstrates that miR-143 and miR-145 are not expressed in colonic epithelial cells; rather, these two miRNAs are highly expressed in mesenchymal cells such as fibroblasts and smooth muscle cells. The expression patterns of miR-143 and miR-145 and other miRNAs were initially determined from tissue level data without consideration that multiple different cell types, each with their own unique miRNA expression patterns, make up each tissue. Herein, we discuss the early reports on the identification of dysregulated miR-143 and miR-145 expression in colorectal cancer and how lack of consideration of cellular composition of normal tissue led to the misconception that these miRNAs are downregulated in cancer. We evaluate mechanistic data from miR-143/145 studies in context of their cell type-restricted expression pattern and the potential of these miRNAs to be considered tumor suppressors. Further, we examine other examples of miRNAs being investigated in inappropriate cell types modulating pathways in a non-biological fashion. Our review highlights the importance of determining the cellular expression pattern of each miRNA, so that downstream studies are conducted in the appropriate cell type.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,890
Score d'incertitude au seuil0,721

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle