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Enregistrement W1996654743 · doi:10.1074/jbc.m110.164467

Proline Periodicity Modulates the Self-assembly Properties of Elastin-like Polypeptides

2010· article· en· W1996654743 sur OpenAlexafffund
Lisa D. Muiznieks, Fred W. Keeley

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésElastinTropoelastinProlineFibrilBiophysicsMonomerChemistryAmyloid (mycology)BiochemistryExtracellular matrixAmino acidBiologyPolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elastin is a self-assembling protein of the extracellular matrix that provides tissues with elastic extensibility and recoil. The monomeric precursor, tropoelastin, is highly hydrophobic yet remains substantially disordered and flexible in solution, due in large part to a high combined threshold of proline and glycine residues within hydrophobic sequences. In fact, proline-poor elastin-like sequences are known to form amyloid-like fibrils, rich in β-structure, from solution. On this basis, it is clear that hydrophobic elastin sequences are in general optimized to avoid an amyloid fate. However, a small number of hydrophobic domains near the C terminus of tropoelastin are substantially depleted of proline residues. Here we investigated the specific contribution of proline number and spacing to the structure and self-assembly propensities of elastin-like polypeptides. Increasing the spacing between proline residues significantly decreased the ability of polypeptides to reversibly self-associate. Real-time imaging of the assembly process revealed the presence of smaller colloidal droplets that displayed enhanced propensity to cluster into dense networks. Structural characterization showed that these aggregates were enriched in β-structure but unable to bind thioflavin-T. These data strongly support a model where proline-poor regions of the elastin monomer provide a unique contribution to assembly and suggest a role for localized β-sheet in mediating self-assembly interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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