Functional Relevance of the Conserved DNA-binding Domain of STAT2
Notice bibliographique
Résumé
Several distinct type I interferon (IFN)-inducible STAT2-containing complexes have been identified. For the IFN-stimulated gene factor 3 (ISGF3), STAT1 and IRF-9 mediate IFN-stimulated response element (ISRE) binding, whereas STAT2 provides a potent transactivational domain. ISGF3-independent STAT2-containing complexes, specifically STAT2:1 and STAT2:3, bind a gamma-activated sequence (GAS)-like element, yet the contribution of each STAT to DNA binding is unknown. Moreover, the contribution of these ISGF3-independent STAT2-containing complexes to IFN-inducible responses is not defined. Accordingly, we generated mutant cDNAs, targeting the DNA-binding domain in STAT2. These cDNAs were introduced by transfection into U6A cells lacking STAT2, resulting in a panel of cell lines expressing mutant STAT2 proteins. Studies assessed the sensitivity of U6A cells reconstituted with intact STAT2 (U6A-2) and cells expressing mutant STAT2s (U6A-2E426A,E427A (EE-AA), U6A-2V453I, U6A-2V454I, U6A-2V454A, U6A-2V453I,V454I(VV-II), U6A-2N458A) to IFN-inducible responses. Our data reveal that none of the mutations in the STAT2 DNA-binding domain affected IFN-inducible ISGF3 activation, and only the VV-II mutation restricted antiviral and growth inhibitory responses to IFN. Indeed, U6A-2VV-II cells are refractory to these IFN-inducible biological activities and also exhibit impaired IFN-inducible GAS-driven transcriptional activation and subsequent gene expression. Chromatin immunoprecipitation assays revealed that the VV-II mutation in STAT2 does not abrogate, but reduces the DNA binding activity of STAT2:1 heterodimers. Taken together, these data suggest a role for the conserved DNA-binding domain of STAT2 specific to the activity of ISGF3-independent STAT2-containing complexes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».